Výzkum zjistil, že u bakterií převládají geny rezistence na antibiotika Campylobacter jejunijedna z hlavních příčin alimentárních onemocnění.
Tým zjistil, že více než polovina C. jejuni, izolované od pacientů v Michiganu, jsou geneticky chráněny proti alespoň jednomu antibiotiku používanému v boji proti bakteriálním infekcím. Úplná zpráva týmu se objeví v deníku Mikrobiální genomika.
“Víme, že tyto patogeny jsou tu odjakživa, ale použití sofistikovanějších nástrojů pro sekvenování genomu nám umožňuje podívat se na ně jinak,” říká Shannon Manning, vedoucí projektu a profesor na katedře mikrobiologie a molekulární genetiky na University of Michigan State. “Zjistili jsme, že genomy jsou extrémně rozmanité a obsahují mnoho genů, které je mohou chránit před různými antibiotiky.”
Zpráva týmu poskytuje cenné technické informace pro epidemiology, zdravotníky a další odborníky, ale Manning také zdůrazňuje, co zjištění týmu znamenají pro běžného člověka.
Zatímco většina zdravých dospělých může bojovat s těmito žaludečními problémy bez antibiotik, říká, existují lidé, pro které C. jejuni vyvolává vážné obavy. Infekce mohou vést k hospitalizaci, autoimunitním a neurologickým komplikacím, dlouhodobé invaliditě a dokonce i smrti.
Pochopení rozsahu rezistence na antibiotika u tohoto druhu a také toho, na jaká antibiotika jsou různé kmeny rezistentní, může pomoci pacientům dříve zavést lepší léčebné plány.
“Pokud známe typ genů rezistence na antibiotika, tak kampylobakter má, takže budeme vědět, která antibiotika bychom pacientovi neměli podávat,“ říká Manning. To může vést k lepším výsledkům pacientů a kratším pobytům v nemocnici.
Objev má také širší důsledky. Poté, co se lidé ubrání infekci a patogen je zabit – s antibiotiky nebo bez nich – mohou jejich geny přetrvávat, včetně těch, které zajišťují rezistenci vůči antibiotikům. Ostatní mikrobi pak mohou tyto geny vyzvednout, integrovat je do svých vlastních genomů a získat rezistenci.
“Tohle je velmi důležité. Potravinové patogeny jsou všudypřítomné. Nacházejí se v potravinách, které jíme, ale také ve zvířatech a prostředích, se kterými přicházíme pravidelně do styku,“ říká Manning. “Pokud nesou geny rezistence, nejen že nám mohou způsobit onemocnění, ale mohou snadno přenést geny na jiné bakterie.”
To podtrhuje důležitost hygieny a bezpečnosti potravin, říká Manning, včetně vyvarování se křížové kontaminaci jiných potravin a povrchů před vařením.
Genetická analýza týmu také umožnila výzkumníkům identifikovat hostitele nebo zdroj konkrétních kmenů. To znamená, že mohli předpovědět, zda bakterie pocházejí z konkrétních zvířat, nebo jsou to generalisté, běžně se vyskytující u více hostitelů.
“Když jsme provedli tuto genomickou analýzu, zjistili jsme, že většina pacientů v Michiganu byla infikována kmeny spojenými s kuřecím nebo hovězím hostitelem,” říká Manning. Infekce se také pravděpodobněji vyskytovaly ve venkovských oblastech, zjistil tým, což naznačuje, že expozice těmto zvířatům a jejich prostředí by mohla být důležitá pro sledování a potenciální kontrolu.
Ačkoli Centers for Disease Control and Prevention provozuje národní síť sledování potravinových patogenů, mnoho států, včetně Michiganu, není součástí tohoto systému.
„V Michiganu máme jedinečné ekologické a zemědělské faktory, které mohou ovlivnit to, jak tyto patogeny přežívají a množí se v určitých hostitelích a prostředích,“ říká Manning, jehož tým také studuje další hlavní přispěvatele k nemocem přenášeným potravinami, včetně E-colishigella a salmonela.
„Pokud je nebudete hledat a vyhodnocovat, nebudete schopni určit, které faktory jsou nejdůležitější pro infekce a rezistenci vůči antibiotikům, ani definovat, jak se Michigan liší od jiných regionů,“ říká.
Toto hodnocení je zčásti cílem Michiganského akademického sekvenačního partnerství pro inovace a reakce v oblasti veřejného zdraví neboli MI-SAPPHIRE, grantu, který MDHHS udělil Manningovu týmu v loňském roce. Program MI-SAPPHIRE je také podporován CDC.
Zdroj: Matt Davenport z Michigan State University